小明的數據分析筆記本公眾號 主要分享:
1、R語言和python做數據分析和數據可視化的簡單小例子;
2、園藝植物相關轉錄組學、基因組學、群體遺傳學文獻閱讀筆記;
3、生物信息學入門學習資料及自己的學習筆記!
這個是微信公眾號合集的推文鏈接
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1、R語言ggplot2作圖一些好看的顏色搭配
2、R語言畫三維散點圖展示主成分分析(PCA)的結果
3、R語言ggplot2數據可視化之圖中嵌圖
4、R語言ggplot2可視化展示我國第七次人口普查的基本數據~人口總量和地區分布
5、R語言ggplot2分組箱線圖(boxplot)添加顯著性標記簡單小例子
6、R語言ggstar包:給散點圖的形狀提供更多的選擇
7、R語言pheatmap畫熱圖遇到的一個報錯及原因
8、R語言ggplot2畫棒棒糖圖展示中國十大姓氏
9、R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結果之如何準備自己的數據
10、可能會用到的30個R語言包~第四期
11、R語言ggplot2折線圖(line plot)添加置信區間(CI)展示學術論文作者數量的變化趨勢
12、R語言ggplot2繪制經驗累積分布(empirical cumulative distribution)曲線的簡單小例子
13、R語言ggplot2畫小提琴圖(violin plot)展示學術論文作者數量
14、R語言ggplot2漂亮的熱圖和配色簡單小例子
15、R語言的ggplot2做共線性結果可視化的第一篇筆記
16、R語言maftools包畫oncoplot(瀑布圖)的一個簡單小例子
17、Circoletto可視化Blast結果的簡單小例子
18、R語言做主坐標分析(PCoA)的一個簡單小例子
19、答讀者問:R語言ggplot2如何給坐標軸添加表示分組的線段
20、跟著Science Advances學畫圖:R語言ggplot2畫圖如何讓坐標軸以科學計數法顯示
21、跟著Science Advances學畫圖:R語言ggplot2畫柱形圖如何讓屁股朝右
22、ggplot2作圖共享圖例方法一:ggpubr包的ggarrange()函數以及調整圖例的布局
23、R語言fmsb包畫雷達圖(radar plot)的一個簡單小例子
24、ggplot2畫點和分組橢圓展示主成分分析(PCA)結果的簡單小例子
25、ggplot2畫點和連線展示主成分分析的結果簡單小例子
26、R語言ggplot2分組的小提琴圖加箱線圖簡單小例子
27、答讀者問:R語言ggplot2繪制熱圖展示GO富集分析結果的簡單小例子
28、R語言ggplot2兩個離散變量畫熱圖的簡單小例子
跟著論文學作圖系列
1、跟著Nature Genetics學畫圖:R語言ggplot2畫曼哈頓圖展示XP-CLR score
2、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫基因結構示意圖
3、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2一次性畫好多個餅狀圖
4、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫箱線圖(boxplot)展示D statistic
5、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2散點圖展示PCA結果
6、跟著Nature Genetics學二代測序數據分析:使用NOVOPlasty組裝生菜的葉綠體基因組
7、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫地圖并且疊加餅狀圖的簡單小例子
8、跟著Nature Medicine學畫圖:R語言畫堆積柱形圖以及時間格式數據做坐標軸的操作
9、跟著Nature Medicine學畫圖:R語言散點圖組合頻率分布圖的簡單小例子
10、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2畫小提琴圖
11、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2散點圖并添加擬合曲線和置信區間
12、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2+ggtree+aplot畫氣泡圖組合聚類樹圖
13、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2畫氣泡圖(dotplot)展示基因表達量
14、跟著Nature Methods學畫圖:R語言畫熱圖(pheatmap)展示基因表達量
15、跟著Nature Ecology&Evolution學數據分析:R語言做方差分解的一個簡單小例子