R語言ggplot2科研數據可視化 ~ 推文合集

小明的數據分析筆記本公眾號 主要分享:
1、R語言和python做數據分析和數據可視化的簡單小例子;
2、園藝植物相關轉錄組學、基因組學、群體遺傳學文獻閱讀筆記;
3、生物信息學入門學習資料及自己的學習筆記!

這個是微信公眾號合集的推文鏈接

https://mp.weixin.qq.com/s/8wiO9QpW-1o4qE_C_AIfCg

  • 1、R語言ggplot2作圖一些好看的顏色搭配

  • 2、R語言畫三維散點圖展示主成分分析(PCA)的結果

  • 3、R語言ggplot2數據可視化之圖中嵌圖

  • 4、R語言ggplot2可視化展示我國第七次人口普查的基本數據~人口總量和地區分布

  • 5、R語言ggplot2分組箱線圖(boxplot)添加顯著性標記簡單小例子

  • 6、R語言ggstar包:給散點圖的形狀提供更多的選擇

  • 7、R語言pheatmap畫熱圖遇到的一個報錯及原因

  • 8、R語言ggplot2畫棒棒糖圖展示中國十大姓氏

  • 9、R語言GOplot畫弦圖展示GO富集分析的結果之如何準備自己的數據

  • 10、可能會用到的30個R語言包~第四期

  • 11、R語言ggplot2折線圖(line plot)添加置信區間(CI)展示學術論文作者數量的變化趨勢

  • 12、R語言ggplot2繪制經驗累積分布(empirical cumulative distribution)曲線的簡單小例子

  • 13、R語言ggplot2畫小提琴圖(violin plot)展示學術論文作者數量

  • 14、R語言ggplot2漂亮的熱圖和配色簡單小例子

  • 15、R語言的ggplot2做共線性結果可視化的第一篇筆記

  • 16、R語言maftools包畫oncoplot(瀑布圖)的一個簡單小例子

  • 17、Circoletto可視化Blast結果的簡單小例子

  • 18、R語言做主坐標分析(PCoA)的一個簡單小例子

  • 19、答讀者問:R語言ggplot2如何給坐標軸添加表示分組的線段

  • 20、跟著Science Advances學畫圖:R語言ggplot2畫圖如何讓坐標軸以科學計數法顯示

  • 21、跟著Science Advances學畫圖:R語言ggplot2畫柱形圖如何讓屁股朝右

  • 22、ggplot2作圖共享圖例方法一:ggpubr包的ggarrange()函數以及調整圖例的布局

  • 23、R語言fmsb包畫雷達圖(radar plot)的一個簡單小例子

  • 24、ggplot2畫點和分組橢圓展示主成分分析(PCA)結果的簡單小例子

  • 25、ggplot2畫點和連線展示主成分分析的結果簡單小例子

  • 26、R語言ggplot2分組的小提琴圖加箱線圖簡單小例子

  • 27、答讀者問:R語言ggplot2繪制熱圖展示GO富集分析結果的簡單小例子

  • 28、R語言ggplot2兩個離散變量畫熱圖的簡單小例子

跟著論文學作圖系列
  • 1、跟著Nature Genetics學畫圖:R語言ggplot2畫曼哈頓圖展示XP-CLR score

  • 2、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫基因結構示意圖

  • 3、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2一次性畫好多個餅狀圖

  • 4、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫箱線圖(boxplot)展示D statistic

  • 5、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2散點圖展示PCA結果

  • 6、跟著Nature Genetics學二代測序數據分析:使用NOVOPlasty組裝生菜的葉綠體基因組

  • 7、跟著Nature Genetics 學畫圖:R語言ggplot2畫地圖并且疊加餅狀圖的簡單小例子

  • 8、跟著Nature Medicine學畫圖:R語言畫堆積柱形圖以及時間格式數據做坐標軸的操作

  • 9、跟著Nature Medicine學畫圖:R語言散點圖組合頻率分布圖的簡單小例子

  • 10、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2畫小提琴圖

  • 11、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2散點圖并添加擬合曲線和置信區間

  • 12、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2+ggtree+aplot畫氣泡圖組合聚類樹圖

  • 13、跟著Nature Methods學畫圖:R語言ggplot2畫氣泡圖(dotplot)展示基因表達量

  • 14、跟著Nature Methods學畫圖:R語言畫熱圖(pheatmap)展示基因表達量

  • 15、跟著Nature Ecology&Evolution學數據分析:R語言做方差分解的一個簡單小例子

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