AndroidManifest.xml中有一個package屬性
build.gradle中defaultConfig下有一個applicationId
這兩者有什么區別呢？
在老版本的Eclipse中做android開發程序的包名是一樣的。而在android studio中做android開發則會有兩個類別，一個是 PackageName，是我們項目中指定資源的包名。一個是ApplicationId 是用作發布的時候和引用第三方項目作為識別的包名。
所有的 Android 應用程序都有一個包名。包名是設備上的這個應用程序的唯一標識，也是在谷歌Play商店上的唯一標識。這意味著，一旦你已發布的程序使用了這個包名， 你就永遠都無法改變它；如果修改了就會導致你的應用程序被當作是一個全新的應用程序，你之前的應用程序的用戶也不能更新到使用了新的包名的安裝包。
在此前的 Android Gradle 構建系統中，您的應用程序的包名由你的manifest文件的根元素里的package屬性決定：
AndroidManifest.xml:
<manifest
xmlns:android="http://schemas.android.com/apk/res/android"
package="com.example.my.app"
android:versionCode="1"
android:versionName="1.0" >
然而，這里所定義的包也有第二個目的：它被用來命名你的資源類的包（以及解析任何相關的Activity的類名）。在上面的示例中，生成的 R 類將會是com.example.my.app.R，因此如果您其他包里面的代碼需要引用這些資源，就需要導入com.example.my.app.R
使用新的 Android Gradle 構建系統，你可以輕松構建多個不同版本的應用程序；例如，您可以構建一個“free”版本和“pro”版本的應用程序 （通過使用flavors），并且這些不同版本的程序在 Google Play 商店上應該有不同的包，這樣他們可以被單獨安裝和購買，或者是同時安裝兩個，等等。同樣，您還可以同時創建“debug”、“alpha”和“beta”版本的應用程序 （使用build types），而這些版本的程序同樣可以使用唯一的包名。
同時，您想要在代碼中導入的 R 類必須在這段時間內保持不變 ；在您正在構建您的應用程序的不同版本時您的.java 源文件不應該被更改。
因此，我們解耦了包名稱的兩種用法：
最終的方案是，在您生成的.apk 的manifest 中，并且用于在你的設備和 Google Play 商店來標識你的應用的包，叫做“application id”。
用于在源代碼中來引用您的R類的，并且是解析任何相關的Activity/Service 注冊的包，繼續被稱為“package”。
你可以在你 gradle 文件中，指定application id，如下所示：
app/build.gradle:
apply plugin: 'com.android.application'
android {
compileSdkVersion 19
buildToolsVersion "19.1"
defaultConfig {
applicationId "com.example.my.app"
minSdkVersion 15
targetSdkVersion 19
versionCode 1
versionName "1.0"
}
...
像以前一樣，你需要在 Manifest 文件中指定用于代碼的包，就如上面的Andr??oidManifest.xml示例一樣。
這里說到了最關鍵的部分：當你像上面那樣做時，這兩個包是互相獨立的。你能夠完全自由地重構您的代碼——更改用于Activity和Service的內部包，更新你的Manifest里的包，和重構您的導入語句。這都不會影響到你的程序的最終id，這個最終的id的值總是為你的Gradle文件中指定的applicationId的值。（筆者注：packageName在代碼中使用，通常在AndroidManifest.xml中指定，applicationId則只是用于程序的標識，通常在build.gradle中指定。這樣有一個好處，假如你想發布一個免費版，一個收費版，你只需要在build.gradle中把applicationId后面加上免費版的后綴包名（如".free"），收費版加上收費版的后綴即可，而不需要修改你的其他代碼。）
你可以通過使用以下的 Gradle DSL 方法，為不同的flavors和構建類型修改您的應用程序的 applicationId：
app/build.gradle:
productFlavors {
pro {
applicationId = "com.example.my.pkg.pro"
}
free {
applicationId = "com.example.my.pkg.free"
}
}
buildTypes {
debug {
applicationIdSuffix ".debug"
}
}
....
注意：出于兼容性原因，如果您沒有在您的 build.gradle 文件中定義 applicationId，這個applicationId 將默認為 AndroidManifest.xml 中所指定的相同的值。在這種情況下，這兩個顯然未解耦，并且如果你試圖重構您的代碼也將會意外地更改您的應用程序的 id ！在 Android Studio 中，新建的項目始終會指定這兩個值。
整理自：http://blog.csdn.net/maosidiaoxian/article/details/41719357
