操作步驟:
1. 請自行準備:無水乙醇、異丙醇、滅菌雙蒸水、二甲苯及 1.5mL 離心管。
2. 取出洗滌液,按以下操作:
a) 洗滌液 A:按終濃度 30%的比例加入無水乙醇,如 7mL 加入 3mL 無水乙醇,14mL 加入 6mL 無水乙醇,充分混勻。
b) 洗滌液 B:按終濃度 70%的比例加入無水乙醇,如 3mL 加入 7mL 無水乙醇;6mL 加入 14mL 無水乙醇,充分混勻。
3. 樣本處理:a) 取 5-8 μm 厚石蠟切片 5-10 張(含載玻片),65℃放置 10 分鐘,放入裝有二甲苯的玻璃瓶中,浸泡 10 分鐘后,用手術刀或刀片,將組織刮下,放入 1.5 mL 離心管。b) 將 5-10 張石蠟切片(不含載玻片)直接放入裝有 1.2 mL 二甲苯的 1.5 mL 離心管中,蓋緊管蓋,60℃金屬浴 10 分鐘,取出管子后震蕩 10 秒,12,000 rpm 室溫離心 2 min,徹底棄上清。 c)石蠟塊:手術刀刮取 20-30 mg 石蠟包埋組織樣本(盡量去除石蠟部分),放入裝有 1.2 mL 二甲苯的 1.5 mL 離心管中,蓋緊管蓋,60℃金屬浴 15 分鐘,取出管子后震蕩10 秒,12,000 rpm 室溫離心 2 min,徹底棄上清。d)福爾馬林固定、未包蠟樣本:取 30 mg 樣本,用手術刀盡量切碎,置于 1.5 ml 離心管中,加入 500 μL 滅菌雙蒸水,渦旋振蕩 20 秒, 12,000 rpm 離心 2 min,棄上清。重復 1 次,轉步驟 6 處理。
4. 在上述處理過的脫蠟樣本管中加入 1.2 mL 無水乙醇,旋渦震蕩 30 秒,12,000 g 離心 2 分鐘,棄上清(注意不要倒掉沉淀,少量乙醇可用吸水紙吸去,未包蠟樣本不需此步)。
5. 開蓋,室溫放置 5 分鐘,去除殘留無水乙醇。
6. 加入 170 μL 裂解液 I,30μL 消化液,振蕩混勻,56℃水浴至組織完全消化裂解。(一般為 30-60 分鐘,皮膚、肺臟、子宮等結締組織較多的切片應適當延長消化時間,最好消化至溶液中無可見的組織碎片。)
注意: 如需除去 RNA,可在加入裂解液后先加入 20μL BIOG DNase –Free RNase A(貨號:51006),振蕩混勻,室溫放置 5 分鐘。再加入30μL 消化液,振蕩混勻,56℃水浴至組織完全消化裂解。
7. 加入 200 μL 裂解液 II,振蕩混勻,56℃水浴 5 分鐘。
8. 加入 400μL 異丙醇,充分振蕩混勻。將吸附柱放入收集管內(nèi),將混合物用移液器吸入吸附柱內(nèi),12,000 rpm 離心 2 分鐘,棄收集管內(nèi)廢液。
9. 將吸附柱放回收集管內(nèi),加 500 μL 洗滌液 A 至吸附柱內(nèi),靜置 2 分鐘,12,000 rpm 離心 1 分鐘,棄收集管內(nèi)廢液。
10. 將吸附柱放回收集管內(nèi),加 500 μL 洗滌液 B 至吸附柱內(nèi),12,000 rpm 離心 1 分鐘,棄收集管內(nèi)廢液。
11. 將吸附柱放回收集管內(nèi),加 500 μL 洗滌液 B 至吸附柱內(nèi),12,000 rpm 離心 1 分鐘,棄收集管內(nèi)廢液。
12. 將吸附柱放回收集管內(nèi),12,000 rpm 離心 2 分鐘,離去殘留的洗滌液。同時,按每份樣本 30-50μL 取洗脫液(如 10 份提取樣本,即取300-500μL 洗脫液),放置于滅菌 1.5mL 離心管,65℃預熱。
13. 取出吸附柱,放入新的滅菌離心管內(nèi),加入 30-50 μL 預熱的洗脫液,靜置 2 分鐘,12,000 rpm 離心 2 分鐘,收集 DNA 溶液。提取的DNA 即可用于下一步實驗或-20℃保存。
注意事項:
1、洗滌液在使用前應加入乙醇后充分混勻,最好現(xiàn)用現(xiàn)配,每次根據(jù)所需提取的樣本量計算后適量配制。
2、本試劑盒提取 DNA 品質(zhì)有賴于樣本本身的質(zhì)量,組織是否及時固定、固定時間、固定劑種類等均影響 DNA 的完整性。組織放置時間過長未及時固定、固定時間過長超過 24 小時、組織脫蠟不徹底、消化不完全等,都會影響 DNA 的得率和質(zhì)量。
3、石蠟切片厚度不宜超過 8 μm,組織塊應盡可能切碎或用液氮研磨,以便消化完全。
4、裂解液、消化液、洗滌液含有刺激性化學物質(zhì),操作過程請做好防護措施,避免直接接觸皮膚,防止吸入口鼻。