蛋白修飾是蛋白質功能調控的重要機制，對于生物學研究和藥物開發具有重要意義。以下是一些與蛋白修飾相關的數據庫資源：

以下是21個與蛋白修飾相關的數據庫的詳細介紹：

燈塔索引（dotaindex）

類型：磷酸化、泛素化和乙酰化等蛋白修飾的綜合性數據庫。

特點：涵蓋蛋白修飾和基因修飾的綜合性數據庫

PhosphoSitePlus?

類型：磷酸化、泛素化和乙酰化等修飾位點數據庫。

特點：提供實驗驗證的蛋白質修飾位點，包括激酶和磷酸酶底物，以及相關的生物學數據。

dbPTM

類型：全面的蛋白質修飾數據庫。

特點：收錄了多種蛋白質修飾類型，包括磷酸化、糖基化、泛素化等，并提供修飾位點的詳細信息。

UniProt

類型：蛋白質序列和功能數據庫。

特點：雖然不是專門的修飾數據庫，但提供蛋白質的序列信息，其中包含已知修飾位點的注釋。

PubMed

類型：生物醫學文獻數據庫。

特點：可以檢索到大量關于蛋白質修飾的研究論文，是獲取最新研究進展的重要資源。

Signor

類型：信號傳導、分子相互作用和蛋白質修飾數據庫。

特點：收集了信號通路中的分子相互作用和修飾事件，有助于理解細胞信號傳導。

RESID

類型：蛋白質修飾殘基數據庫。

特點：提供蛋白質修飾殘基的詳細化學結構和相關的生物學信息。

MODbase

類型：蛋白質修飾位點數據庫。

特點：專注于蛋白質修飾位點的收集和分類，包括實驗驗證的數據。

GlyConnect

類型：蛋白質糖基化修飾數據庫。

特點：提供糖基化位點的詳細信息，以及糖蛋白的生物學功能。

PepBank

類型：蛋白質磷酸化肽段數據庫。

特點：收錄了通過質譜鑒定的磷酸化肽段，用于磷酸化研究。

PHOSPHAT

類型：人類蛋白質磷酸化位點數據庫。

特點：專注于人類蛋白質的磷酸化位點，提供實驗驗證的數據。

SysPTM

類型：系統蛋白質修飾數據庫。

特點：整合了多種蛋白質修飾類型的數據，提供全面的PTM信息。

MIMP

類型：人類蛋白質甲基化修飾數據庫。

特點：專注于人類蛋白質的甲基化修飾，提供位點信息和生物學功能。

O-GlycBase

類型：蛋白質O-連接糖基化數據庫。

特點：提供O-連接糖基化位點的詳細信息，以及相關的蛋白質序列和結構。

SNObase

類型：蛋白質硫酸化修飾數據庫。

特點：收錄了蛋白質硫酸化位點的數據，以及相關的生物學功能。

Amino Acid Modification Database (AAMD)

類型：蛋白質氨基酸修飾數據庫。

特點：提供氨基酸修飾的類型、位置和生物學意義。

PDBsum

類型：蛋白質結構數據庫。

特點：提供蛋白質的三維結構信息，包括修飾位點的具體位置。

PTMfunc

類型：蛋白質修飾功能分析數據庫。

特點：分析蛋白質修飾的功能性后果，幫助理解修飾對蛋白質功能的影響。

PTMcode

類型：磷酸化修飾模式和代碼數據庫。

特點：研究磷酸化修飾的模式和代碼，揭示磷酸化在信號傳導中的作用。

KinasePhos

類型：人類激酶磷酸化位點數據庫。

特點：專注于激酶介導的磷酸化位點，提供激酶底物信息。

NetPhos

類型：磷酸化位點預測工具和數據庫。

特點：在線預測蛋白質序列中的磷酸化位點，并提供實驗驗證的數據。

這些數據庫為研究者提供了強大的工具，可以幫助他們在蛋白質修飾領域進行深入的研究。在使用這些數據庫時，研究者應該注意數據庫的更新頻率、數據質量、覆蓋范圍和用戶界面等因素。