學習小組Day7筆記--紙心

各代測序

各代測序原理介紹

以下引自美格基因


第一代測序(Sanger測序)
第二代測序
第三代測序

各代測序對比

以下引自生信星球


生信星球

最后是各組學的介紹(引自生信星球)

1.基因組學(核酸序列分析)

(1)全基因組測序(WGS)
(2)全外顯子組測序(WES)
(3)簡化基因組測序(RRGS)
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS(也就是ddRAD)
作用:
(1)基因組作圖(遺傳圖譜、物理圖譜、轉錄本圖譜)
(2)核苷酸序列分析
(3)基因定位
(4)基因功能分析
其它:
以全基因組測序為目標的結構基因組學
以基因功能鑒定為目標的功能基因組學

2.轉錄組學(基因表達分析)

(1)mRNA-Seq
(2)IncRNA-Seq(長鏈非編碼RNA)
(3)sRNA-Seq(主要是miRNA-Seq)
作用:
(1)獲得物種或者組織的轉錄本信息
(2)得到轉錄本上基因的相關信息,如基因結構功能等
(3)發(fā)現(xiàn)新的基因
(4)基因結構優(yōu)化
(5)發(fā)現(xiàn)可變剪切
(6)發(fā)現(xiàn)基因融合
(7)基因表達差異分析

3.蛋白質(zhì)組學

(1)蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)處理、蛋白及其修飾鑒定
(2)構建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、相關軟件的開發(fā)和應用
(3)蛋白質(zhì)結構功能預測
(4)蛋白質(zhì)連鎖圖

4.代謝組學

(1)代謝物指紋分析
(2)代謝輪廓分析

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