conda官網：https://conda.io/miniconda.html

1.下載Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2.安裝

chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh #給執行權限

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#安裝

3.安裝完成后可以選擇加入PATH，若不加入PATH 進入miniconda/bin文件? conda activate 進入conda環境

4.給conda添加頻道，以下兩個為官方提供的頻道

conda config --add channels bioconda

conda config --add channels conda-forge

5.用conda安裝軟件，這里以安裝R為例

創建R環境安裝R

?? (1)conda activate? #進入conda 環境

?? (2)conda create -n R3.8 #創建一個R環境

?? (3)source activate R3.8 #激活R環境

?? (4)conda install r-base #安裝R

?? (5)conda install r-stringi #安裝R包 以 stringi R包為例

?? (6)conda deactivate 退出當前環境

在不創建R環境的情況下安裝R conda install -c r r?

其他查看命令：

conda info --envs ? #查看當前環境 ? *標記

conda list #查看環境下安裝的R包和版本

conda env remove -n R3.8 #刪除該環境

conda env list? #查看所有環境

軟件安裝完 不能只讓他在conda環境下發揮作用，在目錄下（隨便一個喜歡的目錄）建文件夾aa 將conda目錄下 軟件的bin文件 通過軟連接 放到aa文件夾下? ：ln -s ~/miniconda3/bin/R? /aa?

當我把deeptools 軟連接過去 其里面的命令找不到，子命令也在bin里，全部軟連接過去

將aa文件夾所在目錄加入 ~/.bashrc PATH中，并 source ~/.bashrc? OK啦??！!

小問題：有時候安裝完conda 每當source ~/.bashrc 就會進入conda環境 ，怎么解決呢？

vim ~/.bashrc #打開 ~/.bashrc

注釋掉以下部分