knock-down
adipogenesis
fat
PPARγ
siRNA
1、Notch1 有爭議 但是可以抗炎 1和4 均可以 膜蛋白 均有結構
結論 Notch信號抑制可通過降低PI3K/Akt通路的活性促進hADSCs成脂。
雖然細胞增殖和分化應該是互斥的,但我們的研究表明,N4IC 促進 3T3-L1 細胞的增殖和分化。先前關于 Notch 參與脂肪生成的研究表明,Notch 信號傳導是一種負調節因子;盡管如此,本研究的結果證實 Notch4 促進前脂肪細胞的分化。
肝細胞 TLR4 觸發肝細胞間 Jagged1/Notch 信號轉導以確定 NASH 誘導的纖維化 - PubMed --- Hepatocyte TLR4 triggers inter-hepatocyte Jagged1/Notch signaling to determine NASH-induced fibrosis - PubMed
在這里,我們發現在人肝活檢標本和小鼠 NASH 模型中,Notch 配體 Jagged1 (JAG1) 的表達增加與 Notch 激活和非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 活性評分 (NAS) 一起追蹤。Jag1 的增加是由中央周圍肝細胞 Toll 樣受體 4 (TLR4)-核因子 κB (NF-κB) 信號介導的。肝細胞特異性 Jag1 過表達加劇了喂食高脂肪飲食或富含棕櫚酸酯、膽固醇和蔗糖的 NASH 誘發飲食的小鼠的纖維化,并逆轉了肝細胞特異性 TLR4 缺失提供的保護,而肝細胞特異性 Jag1 敲除小鼠免受 NASH 誘導的肝纖維化的影響。為了測試這種生物學的治療潛力,我們設計了一種 Jag1 導向的反義寡核苷酸 (ASO) 和肝細胞特異性 N-乙酰半乳糖胺 (GalNAc) 修飾的 siRNA,這兩種藥物都減少了 NASH 飲食誘導的小鼠肝纖維化。總體而言,這些數據表明,肝細胞 Jagged1 增加是 Notch 誘導的小鼠肝纖維化的近端命中,并表明 Jagged1 抑制劑在 NASH 患者中的轉化潛力。
Notch信號通路其他靶點
A CSL/RBP-Jκ蛋白
CSL蛋白(CBF1/Su(H)/LAG-1)在人類中的對應基因是 RBPJ(Recombination Signal Binding Protein for Immunoglobulin Kappa J Region),位于染色體9q34.3。該基因編碼的蛋白是Notch信號通路的核心轉錄因子,負責結合DNA并調控下游靶基因(如HES、HEY家族)的表達。
RBPJ 是轉錄因子 ,抑制起反作用
B MAML家族蛋白
作用機制:Mastermind樣蛋白(MAML1-3)是三元復合體的共激活因子,其N端與NICD的ANK結構域結合,C端招募組蛋白乙酰轉移酶p300,促進染色質開放和轉錄激活。
抑制劑開發:IMR-1及其代謝物IMR-1A通過阻斷MAML與NICD的互作抑制復合體形成,在乳腺癌和T細胞淋巴瘤中顯著抑制腫瘤生長。臨床試驗顯示其安全性優于泛Notch抑制劑。
MAML1 有結構,2、3沒結構。但是都在細胞核。
C
D
2、ATXN1 就2篇文獻 細胞質 有結構
-
異位脂肪庫的多種族全基因組薈萃分析確定了與脂肪細胞發育和分化相關的位點 - PubMed --- Multiethnic genome-wide meta-analysis of ectopic fat depots identifies loci associated with adipocyte development and differentiation - PubMed
原代小鼠脂肪祖細胞中 ATXN1 或 Ube2e2 的功能喪失損害了脂肪細胞分化,表明 ATXN1 和 UBE2E2 在脂肪生成中的生理作用。
image.png
小鼠對應的基因是 SCA1
論文里面關于SCA1的文獻
Sca1:前脂肪細胞細胞可以通過血小板衍生生長因子受體 α
(PDGFRα)和干細胞抗原 1(Sca1)的細胞表面表達來識別[17,31-33]。
17
31-33
- 通過 β3-腎上腺素能受體激活和高脂肪喂養招募的雙潛能脂肪細胞祖細胞的體內鑒定 - PubMed --- In vivo identification of bipotential adipocyte progenitors recruited by β3-adrenoceptor activation and high-fat feeding - PubMed
- 確定用于脂肪組織重塑和恢復的成脂生態位 - PubMed --- Identification of an adipogenic niche for adipose tissue remodeling and restoration - PubMed
- 在成人白色脂肪組織中尋找脂肪細胞的來源 - PubMed --- Seeking the source of adipocytes in adult white adipose tissues - PubMed
Sca1是流式篩選小鼠前脂肪細胞的 marker 蛋白[25,34]。
25
34
3、CD44 不行 抑制CD44 會促進脂肪生成
4、LGALS3 潛在的靶點 在細胞質且有結構
這是脂肪相關巨噬細胞的靶點
研究表明,半乳糖凝集素 3(LGALS3)也具有重要的促進脂肪生
成的能力。LGALS3 可以促進小鼠成纖維細胞的脂肪生成[114]。且有研究表
明,LGALS3 敲低顯著降低 3T3-L1 細胞中脂肪細胞分化,同時降低了
PPARγ 的表達[115]。
114
-
半乳糖凝集素-3 促進 PDGFRα+ 細胞的成脂分化和再生肌肉中的異位脂肪形成 - PubMed --- Galectin-3 promotes the adipogenic differentiation of PDGFRα+ cells and ectopic fat formation in regenerating muscle - PubMed
摘要
全球肥胖癥的患病率與生活方式相關疾病的增加有關。肌間脂肪組織 (IMAT) 的積累被認為是肥胖導致肌肉減少癥和代謝紊亂的主要問題,因此是治療這些病理狀況的有前途的靶點。然而,雖然肥胖相關的 IMAT 被認為起源于 PDGFRα + 間充質祖細胞,但這種脂肪生成的過程在很大程度上仍未得到探索。在這里,我們使用單細胞 RNA 測序和質譜法全面研究了與這些過程相關的細胞內和細胞外變化。我們的單細胞 RNA 測序分析在肥胖小鼠中發現了一個小的 PDGFRα + 細胞群,強烈地指向脂肪生成。蛋白質組學分析顯示,該細胞群的出現伴隨著間質環境中半乳糖凝集素-3 的增加,發現其可激活 PDGFRα + 細胞中的成脂 PPARγ 信號。此外,半乳糖凝集素-3 敲除小鼠肌肉再生過程中的 IMAT 形成受到顯著抑制。我們的研究結果與這些多組學數據集一起,可以解開肌肉再生過程中的微環境網絡,突出針對肥胖癥中 IMAT 形成的可能治療靶點。
更有趣的是,我們發現半乳糖凝集素-3 是 PPARγ 信號轉導的正調節因子 (Baek et al., 2015),在 HFD 喂養小鼠的間質基質組織中表達水平較高。因此,我們從 ND 喂養的小鼠中新鮮分離 PDGFRα + 細胞,并用重組半乳糖凝集素-3 處理它們。為了支持這一觀察的生物學意義,我們證實重組半乳糖凝集素-3 增強了 PPARγ 表達并促進了原代培養的 PDGFRα + 細胞的成脂分化( 圖 5C、D)。相比之下,半乳糖凝集素-3 抑制劑 TD139 抑制了原代培養的 PDGFRα+ 細胞中 PPARγ 的表達( 圖 5E)。
115
這篇文章,誘導脂肪生成,用地塞米松、3-異丁基-1-甲基黃嘌呤、胰島素 (DMI) 和羅格列酮處理。
這篇文章看下來,LGALS3的抑制脂肪生成不是那么強,敲除小鼠中,高脂飲食與對照肝臟組織學沒有差異。
116
摘要
脂肪病是脂肪組織 (AT) 對過度喂養的病理性反應,其特征是由于脂肪生成受損導致 AT 膨脹性降低,這有利于炎癥、胰島素抵抗 (IR) 和異常的葡萄糖調節。然而,目前尚不清楚脂肪生成缺陷是否也會導致代謝紊亂,也獨立于對脂肪儲存的需求增加。由于半乳糖凝集素-3 與脂肪細胞分化和葡萄糖穩態有關,我們在喂食標準食物的半乳糖凝集素-3 敲除 (Lgal3-/-) 小鼠中測試了這一假設。在體外,Lgal3 - /- 脂肪細胞前體顯示終末分化受損 (成熟)。兩個月齡的 Lgal3 - /- 小鼠表現出 AT 成熟受損,脂肪細胞大小和成脂基因表達減小,但脂肪量不變,沒有脂肪細胞變性/死亡或異位脂肪堆積的跡象。AT 不成熟與 AT 和全身炎癥和 IR 、葡萄糖耐量異常和高血糖相關。5 個月大的 Lgal3 - /- 小鼠表現出更成熟的 AT 表型,與 WT 動物相比,胰島素敏感性和炎性細胞因子表達沒有差異
,盡管異常葡萄糖穩態持續存在并且與 β 細胞功能降低有關。這些數據表明,脂肪生成能力本身會影響 AT 功能、胰島素敏感性和葡萄糖穩態,而與脂肪攝入量、積累和重新分布的增加無關,從而揭示了脂肪生成缺陷、IR 和糖尿病易感性之間的直接聯系。
在成纖維細胞里面看了一下,結果如下:
不是在前脂肪細胞中表達。
5、PPARG 好像起反作用
-
人類前脂肪細胞中 CRISPR/Cas9 基因編輯的概念驗證:FKBP 5 和 PPARG 的缺失以及對脂肪細胞分化和代謝的影響- PubMed --- Proof-of-concept for CRISPR/Cas9 gene editing in human preadipocytes: Deletion of FKBP5 and PPARG and effects on adipocyte differentiation and metabolism - PubMed
我們敲除了前脂肪細胞中的 FKBP 5 和 PPARG 基因,并研究了由此產生的表型。PPARG 敲除阻止分化成脂肪細胞。
PPARA好像也是
討論部分值得看
6、marker基因靶點 1-3 是Fibr-COL5A1 亞群,
(1)TRIO 全長 3097 有結構 在胞質 但是是酶
(2)MAP4K4 (絲裂原活化蛋白激酶 4) 全長 1239 有結構 在胞質
(3)SND1 全長 910 有結構 在胞質 以及核內 備選
剪接機制失調與非酒精性脂肪肝的發生有關 - PubMed --- Dysregulation of the Splicing Machinery Is Associated to the Development of Nonalcoholic Fatty Liver Disease - PubMed
此外,某些剪接機械成分(即 PTBP1、RBM45、SND1)的體外沉默減少了脂肪堆積并調節了關鍵從頭脂肪生成酶的表達RNA 誘導的沉默復合物 (RISC) 活性增加導致肝細胞癌 - PubMed --- Increased RNA-induced silencing complex (RISC) activity contributes to hepatocellular carcinoma - PubMed
抑制 SND1 的酶活性顯著抑制人 HCC 細胞的增殖。作為推論,SND1 增強和 siRNA 介導的 SND1 抑制的穩定過表達在體外和體內消除了人 HCC 細胞的生長,從而揭示了 SND1 在肝癌發生中的潛在作用。
(4) ELMO1 全長 727 有結構 在胞質和細胞膜 備選
ELMO1 - Engulfment and cell motility protein 1 - Homo sapiens (Human) | UniProtKB | UniProt
類風濕性關節炎的綜合組學分析確定了不明顯的治療靶點 - PubMed --- Integrative omics analysis of rheumatoid arthritis identifies non-obvious therapeutic targets - PubMed
因此,我們在 ELMO1 和 RA 致病性之間建立了聯系,這反過來又驗證了 ELMO1 是潛在的 RA 治療靶點。ELMO1 信號傳導是破骨細胞功能和骨丟失的促進子 - PubMed --- ELMO1 signaling is a promoter of osteoclast function and bone loss - PubMed
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