一步法熒光定量試劑盒的選擇標(biāo)準(zhǔn)

實時熒光定量(RT-qPCR)想必大家都不陌生,根據(jù)其實驗步驟的不同,可以分為“一步法”與“兩步法”。目前來說,兩步法研究者用的比較多,即是將反轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增分兩步進(jìn)行,首先從RNA模板反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,得到的cDNA再進(jìn)行一次或多次不同的PCR反應(yīng)。這種方法的最大優(yōu)點是可以保存反轉(zhuǎn)錄后的cDNA產(chǎn)物,但對于需要對大量樣品進(jìn)行分析或定量PCR,又或是對防污染要求比較高的研究者來說是不適用的,而一步法RT-qPCR就很好的解決了這類實驗難題。

簡單來說,一步法熒光定量就是逆轉(zhuǎn)錄和定量PCR在一個反應(yīng)管內(nèi)一步完成,使逆轉(zhuǎn)錄酶與DNA聚合酶在同一管內(nèi)同樣緩沖液條件下完成反應(yīng),整體實驗操作簡便,非常適合于研究生使用。目前,除了像Thermo Fisher此類國際生物試劑品牌,國內(nèi)的像BIOG也有用下來不錯的一步法熒光定量試劑盒,這些試劑普遍具有以下幾個特點:

1、操作簡單

加樣環(huán)節(jié)少,兩步反應(yīng)都在一個管中完成,這種方法能克隆微量mRNA 而不需構(gòu)建 cDNA 文庫,省略了cDNA與qPCR反應(yīng)之間體系轉(zhuǎn)換的過程,操作方便快捷,也大大提高了實驗的效率,非常適用于高通量擴(kuò)增/篩選;

2、減少污染

cDNA合成和擴(kuò)增之間不需要打開反應(yīng)管蓋,更少的移液步驟能夠減少污染的風(fēng)險,同時具有更少的實驗誤差;

3、靈敏度更高

一步法反轉(zhuǎn)錄得到的所有cDNA都用來擴(kuò)增,所以相比于兩步法來說靈敏度更高,可高出10倍,且最低可檢測到1 pg總RNA中的目標(biāo)片段,有些兩步法無法檢測到的數(shù)據(jù),用一步法可以檢出。

此外,我們還購買了一款國產(chǎn)品牌的一步法RT-qPCR試劑盒與BIOG的進(jìn)行了比較,結(jié)果如下圖所示,從擴(kuò)增曲線結(jié)果來看,BIOG一步染料法熒光定量PCR試劑盒反應(yīng)更為靈敏,線性范圍寬,穩(wěn)定性好。


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