瑞典生物學家林奈將生物命名后，而后的生物學家才用域(Domain)、界（Kingdom）、門（Phylum）、綱（Class）、目（Order）、科（Family）、屬（Genus）、種（Species）加以分類。種是最基本的分類單位，科是最常用的分類單位。
最上層的界，由懷塔克所提出的五界，比較多人接受，分別為原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及動物界
當前最流行的分類是一種五界系統，分別為原核生物界、原生生物界、菌物界、植物界以及動物界。五界系統反映了生物進化的三個階段和多細胞階段的三個分支，是有縱有橫的分類。它沒有包括非細胞形態的病毒在內，也許是因為病毒系統地位不明之故。它的原生生物界內容龐雜，包括全部原生動物和紅藻、褐藻、綠藻以外的其他真核藻類，包括了不同的動物和植物。例舉：斑馬魚的界門綱目科屬種：動物界，脊椎動物門，硬骨魚綱，鯉形目，鯉科，短擔尼魚屬。
