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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——NMDS分析???? ，即非度量多維尺度分析（NMDS analysis and plot NMDS），是一種將多維空間的研究對象（樣本或變量）簡化到低維空...
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基于R語言的微生物群落組成分析—差異OTU篩選及展示安裝、加載R包 加載數據 OTU差異分析 1、構建DESeqDataSet對象 2、差異分析 3、提取分析結果 4、統計結果 5、合并數據 設置...
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基于LEfSe分析進行微生物物種差異及關聯分析????LEfSe（LDA Effect Size）分析是一種用于發現和解釋高維度數據生物標識（基因、通路和分類單元等）的分析工具。在微生物分析...
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——PCA分析????PCA，即主成分分析（Principal Component Analysis），是一種考察多個變量間相關性的降維統計方法，其原理是設法...
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——CCA分析????之前文章中我們講到過冗余分析（redundancy analysis, RDA），今天我們來講另一種分析——典范對應分析（canonic...
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——RDA分析????此前文章中小編已經給大家介紹了微生物群落組成多樣性分析的三大主要板塊——Alpha多樣性分析、Beta多樣性分析及群落結構組成分析。然而...
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基于R語言如何實現偏最小二乘法判別分析（PLS-DA）？????偏最小二乘法判別分析，即我常說的PLS-DA（Partial Least Squares Discriminant Analysis），...
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——共線性網絡分析????之前有一位粉絲后臺留言說能不能出一期有關于共線性網絡的文章，說實話，小編之前只在文獻中看到過這類圖，對于其原理也是迷迷糊糊?？戳撕枚鄤e人...
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基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——物種豐度可視化之熱圖（Heatmap）引言 ????上一期內容我們介紹了基于R語言對微生物豐度進行計算并進行可視化，今天這期內容主要介紹如何使用熱圖（Heatmap）來展示物種豐度的...