20篇文章 · 7301字 · 11人關注
-
使用RSEM進行轉錄組測序的差異表達分析
仍然是兩年前的筆記 1. prepare-reference 如果用RSEM對比對后的bam進行轉錄本定量，則在比對過程中要確保比對用到的索引是...
-
一文學會常規轉錄組分析
數據來源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at ...
-
玩轉生存分析，這一篇就夠了1. 導入數據 注意，因為我為了自動補全變量名，使用了attach()。如果沒有用這個，像survfit() coxph()這些函數還需要加上d...
-
Stata極簡生存分析1. 導入數據 2. 將原始數據轉換為生存數據 3. KM生存曲線 4. log-rank檢驗 5. Cox比例風險模型 6. PH假定的檢驗
-
第一篇SCI這是一篇純生信的3.5分文章，主要涉及的是小RNA: phasiRNA。小麥的基因組前兩年才發表，而類似的研究以前在水稻中做過比較多，因此對于做...
-
自定義基因集，運行GSEAGSEA涉及到很多文件格式，參考：GSEA數據格式。 在《GTEx: 如何找組織特異表達的基因》中，已經討論了如何求組織特異表達的基因集，這里直...
-
GTEx: 如何找組織特異表達的基因官網--https://gtexportal.org/home/數據下載鏈接--https://gtexportal.org/home/data...
-
small RNA學習（八）：降解組分析1. 降解組（測序）是什么？分析原理是什么？ 在植物中，通常miRNA與靶標序列結合緊密，在結合位點的第10/11位堿基處直接剪切mRNA從而調...
-
small RNA學習（七）：小RNA的靶基因預測
用到的軟件是TargetFinder，軟件的具體安裝見：https://github.com/carringtonlab/TargetFinde...
