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STEP9:確認LNCRNA是否真的是lncRNA
lncRNA具有一系列獨特特性，這些特性與編碼蛋白質的mRNA有或多或少的區別。需要將鑒定出的新lncRNA與數據庫中的lncRNA以及蛋白質編...
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STEP8:鑒定全新的lncRNA
這個時候已經不是表達矩陣的事情了，要從新從fastq測序數據開始。對測序后的fastq數據進行轉錄本的組裝。基于組裝后的轉錄本，通過數據庫注釋去...
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STEP6:WGCNA相關性分析因為樣本數量比較可觀，所以可以進行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標準可以是top變異程度大的基因集合，或...
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STEP5:差異表達的mRNA和lncRNA很明顯，得到了表達矩陣之后，根據上面的樣本信息，可以按照年齡，性別，取樣部位來進行分組找差異。可以參考：https://github.com/j...
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STEP4: 得到表達矩陣的流程SRA—>FASTQ—>BAM—>COUNTS 這幾個步驟而已，中間穿插一些質控的手段，每個步驟選擇好合適的軟件即可。可以參考：一個植物轉錄組項...
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STEP3:了解參考基因組及注釋文件下載原始測序數據： 在GEO數據庫搜索GSE87182, 這里沒有直接給出ftp地址，需要先從BioProject找到SRA號，可以得到RNA-...
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STEP2：文獻閱讀
“ Annotation and cluster analysis of spatiotemporal- and sex-related lnc...
