PS：也適用于找不到包的情況，不僅僅是依賴...最近整合了團隊的幾部機器，做成了小集群，于是很多計算環境重新部署。這兩天有個項目需要返工，發現之...
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R語言: ERROR: dependency ‘XXXX’ is not available for package ‘YYYY’ -
點點點，KEGG Pathway 通路富集分析寫在前面 前段時間，推過兩個教程，分別是：1.《零基礎快速完成基因功能注釋 / GO / KEGG / PFAM...》2.《「GO富集分析」從...
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統計多個基因列表交集并畫韋恩圖和Upset圖有時候，我們從GEO數據庫挖掘了好幾組數據集的差異表達基因，我們需要統計這些基因列表的交集，一般可以用韋恩圖和Upset圖。而韋恩圖一般適合小樣...
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我的GWAS高級曼哈頓圖折騰過程如果說別人畫圖是折騰自己，那我畫圖可能就是折騰自己兼折騰群主.......首先在這里感謝何大哥哈（知乎：hewm2008）、很耐心的為我解答了許...
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跨物種RNA-seq標準化及差異表達前言 對跨物種的RNA-seq進行標準化和差異分析已知是一個問題，而目前對此類問題的相關研究還比較少，有用RPKM進行各物種之間標準化的，也有基...
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學好統計，我10分鐘就完成了別人服務器通宵才完成的分析果子老師做過一個非常驚人的舉動，用DESeq2處理1225例樣本的TCGA數據，在沒有使用DESeq多線程參數parallel的情況下，跑了將近...
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群體遺傳分析—LD連鎖不平衡本文轉載于百邁克云(https://www.sohu.com/a/234594093_761120) 在群體遺傳學研究中，LD連鎖不平衡分析是最...
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資源 | RNAseq數據分析 - 一本通 - 葵花寶典寫在前面 五年前，《生信札記》公眾號成立不久，我間斷發了幾個推文，然后就沒再繼續運營了。直到三四年前，花了點時間，于是現在這樣。有不少老友估計都...
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TBtools | 多圖合一至強版教程！進化樹 + Motifs + 結構域 + 啟動子 + 基因結構 + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個功能可以說...
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貼心 | GXF Fix 修復 / 優化基因結構注釋信息文件 - GTF/GFF3寫在前面 目前基因組測序和組裝成本幾乎已經到任何一個課題組都可以單獨負擔的價碼，大量物種的基因組序列被測定和釋放。與此同時，對應的基因結構注釋信...
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