任意基因的任意分組比較是生信技能樹[生信爆款入門課程]TCGA數據挖掘部分提到的一個重點。為拓展課堂所學知識,現在對其做下練習鞏固和總結。 1....

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任意基因的任意分組比較是生信技能樹[生信爆款入門課程]TCGA數據挖掘部分提到的一個重點。為拓展課堂所學知識,現在對其做下練習鞏固和總結。 1....
今天分享一篇TCGA數據挖掘(miRNA)+細胞功能實驗發文思路的文章,這篇于2021年2月21日在World J Surg Oncol上發表。...
加載之前下載并保存的文件 注意:這里介紹的差異分析方法有三種,其中limma是最經典的,但是limma是必須接受log之后的值,才能正確算出差異...
熱圖(Heatmap):用顏色變化直觀的表達數據之間差異的圖,是對實驗數據進行質制和差異數據的展現,是數據挖掘類文章的標配。 例如上圖,每個小方...
加載表達矩陣和生存數據 進行lasso回歸,找到最佳建模位置 再用得到的最佳的位置去建模 判斷預測結果的準確性 后面這段是補充,可以不用看了。。...
讀取基因對應類型的數據 讀取表達矩陣 把表達矩陣的中對應的lincRNA的基因挑選出來 最后 感謝jimmy的生信技能樹團隊! 感謝導師岑洪老師...