傾向性評分匹配（propensity score matching, PSM）主要是在隨機對照試驗(Randomized controlled ...
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傾向性評分匹配完整實例（R實現） -
隨機森林分析第一波隨機森林分析在宏基因組數據分析中還是蠻常見的，所以這里整理一個常規的分析案例 1 | 數據準備 1.1 菌群數據 1.2 樣品信息數據 2 | ...
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用隨機森林算法進一步篩選差異表達基因前言 很多時候，我們分析完差異表達基因后，發現會得到一大堆差異基因，常見的做法有降低Pvalue的閾值，挑選fold-change最大的基因，做...
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「r<-包」使用 ezcox 展示森林圖我之前寫過一篇文章介紹最近寫的一個包 ezcox，它可以用來進行批量處理 Cox 模型（支持并行計算）。那個時候我已經關注到了 forestmo...
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mlr案例：回歸
原英文地址：https://mlr.mlr-org.com/articles/tutorial/usecase_regression.html ...
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SMOTE算法
SMOTE（Synthetic Minority Oversampling Technique），合成少數類過采樣技術．它是基于隨機過采樣算法的...
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2 SVM（支持向量機法）vs 線性回歸+ROC曲線step1 線性回歸ROC與AUC的實現 這是計算affair的一個數據集 step2 繪圖強大的一個包——pROC 雖然ROCR包可以滿足我們...
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機器學習：常用模型評估指標在機器學習建模過程中，針對不同的問題，需采用不同的模型評估指標。 一、分類模型評估指標： 1、混淆矩陣（Confusion Matrix） 2、...
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TMB(腫瘤突變負荷) panel基因篩選TMB背景知識介紹 免疫療法是近年來腫瘤治療的熱點，腫瘤突變負荷(Tumor Mutational Burden，TMB)可以作為免疫療法的bi...
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機器學習幫助識別乳腺癌診斷和分子分型的生物標記物
摘要： 乳腺癌是一種復雜的疾病，其有效治療需要負擔得起的診斷和分型特征。雖然機器學習方法在臨床計算生物學中的使用仍處于起步階段，但鑒定分子生物標...
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