數(shù)據(jù)來(lái)源：Cytosolic acetyl-CoA promotes histone acetylation predominantly at ...
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一文學(xué)會(huì)常規(guī)轉(zhuǎn)錄組分析
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【Pathview web】通路映射可視化前言 pathview是一個(gè)通路可視化友好的R包，最主要的是它支持多組學(xué)數(shù)據(jù)映射（基因/蛋白-代謝）。自己用過(guò)它的R包，后來(lái)發(fā)現(xiàn)有網(wǎng)頁(yè)版的，果斷...
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生信格式中的0-base與1-base
CheatSheet 首先先放上 0-based 和 1-based 的cheatsheet FormatTypeUCSC Genome Bro...
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測(cè)序的世界測(cè)序的世界很奇妙，不同的數(shù)據(jù)處理可能得出不同的結(jié)論，入門(mén)生信首先要做的就是了解你的數(shù)據(jù)還等什么？跟我一起來(lái)探索吧～ 測(cè)序原理： 早期如何測(cè)序呢？...
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幾種標(biāo)準(zhǔn)化方法的學(xué)習(xí)筆記不管在RNA-seq還是ChIP-seq分析中，都涉及到一個(gè)概念，就是標(biāo)準(zhǔn)化。作為一個(gè)剛?cè)腴T(mén)的小白，總是聽(tīng)王院長(zhǎng)和其他熟悉生信分析的同學(xué)們強(qiáng)調(diào)標(biāo)...
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RNAseq實(shí)際操作（實(shí)戰(zhàn)）RNAseq實(shí)際操作（實(shí)戰(zhàn)） 首先聲明，雖然是實(shí)戰(zhàn)，但是其實(shí)是學(xué)習(xí)筆記而已，初學(xué)，參考了大量大神的博客和帖子,還有大神引用的大牛的帖子,參考列表...
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討厭又迷人的reads去重復(fù)在NGS分析入門(mén)階段，我們不需要考慮太多的細(xì)節(jié)，只用知道一個(gè)分析的大致流程并完整跑下來(lái)即可。太多的細(xì)節(jié)，只會(huì)讓我們對(duì)于分析產(chǎn)生莫須有的恐懼，因此...
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NGS 數(shù)據(jù)過(guò)濾之 Trimmomatic 詳細(xì)說(shuō)明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始數(shù)據(jù)過(guò)濾對(duì)后續(xù)分析至關(guān)重要，去除一些無(wú)用的序列也可以提高后續(xù)分析的準(zhǔn)確率和效...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘—生信技能樹(shù)B站視頻以下是B站生信技能樹(shù)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù)：了解數(shù)據(jù)存放位置； 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式； 介紹...
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ascp咋啦？如何從NCBI上下載sra數(shù)據(jù)？前言 今天（3.12日），想在NCBI上下載lncRNA數(shù)據(jù)，突然發(fā)現(xiàn)軟件Aspera的ascp（報(bào)錯(cuò)：ascp: Failed to open...
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