如圖： Github: https://github.com/leekgroup/networks_correction/tree/master...
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分享一個(gè)共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)矯正的方法
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學(xué)做NAR圖表：ggraph做網(wǎng)絡(luò)圖最近在NAR上看到一篇文章： 原文網(wǎng)絡(luò)圖如下： 我們借此機(jī)會(huì)，通過(guò)ggraph作圖解析相關(guān)參數(shù)。詳細(xì)注釋代碼和參數(shù)已上傳QQ群文件！我做的圖如下...
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R語(yǔ)言～繪制網(wǎng)絡(luò)圖加載工具包 加載數(shù)據(jù) 定義一些顏色 篩選優(yōu)勢(shì)物種 構(gòu)建函數(shù)計(jì)算相關(guān)性和共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò) 運(yùn)行函數(shù)，生成結(jié)果 輸出結(jié)果，在gephi中進(jìn)行精加工
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多層網(wǎng)絡(luò)可視化工具（MuxViz）manlius/muxViz: Analysis and Visualization of Interconnected Multilayer ...
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單細(xì)胞加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析scWGCNA-01scWGCNA是一個(gè)生物信息學(xué)工作流程，是R包WGCNA[https://horvath.genetics.ucla.edu/html/Coex...
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R語(yǔ)言可視化（四十）：網(wǎng)絡(luò)圖繪制40. 網(wǎng)絡(luò)圖繪制 清除當(dāng)前環(huán)境中的變量 設(shè)置工作目錄 使用igraph包繪制網(wǎng)絡(luò)圖 使用ggraph包繪制網(wǎng)絡(luò)圖 使用networkD3包繪制...
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WGCNA+代碼實(shí)戰(zhàn)（持續(xù)補(bǔ)充中）什么是WGCNA 1 樣本聚類，查看是否有離群值 2. 找構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)合適的閾值 左圖縱軸：相關(guān)系數(shù)的平方，越高說(shuō)明該網(wǎng)絡(luò)越逼近無(wú)網(wǎng)絡(luò)尺度的分布。右...
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使用WGCNA進(jìn)行meta-analysis
鑒于大量的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，可能出現(xiàn)的一個(gè)問(wèn)題是“如果A組和B組都進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組研究并報(bào)告了一些結(jié)果，這些結(jié)果的相容性如何？”目前基于轉(zhuǎn)錄組或芯片數(shù)據(jù)進(jìn)...
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R數(shù)據(jù)可視化21:Edge Bundling圖N久沒(méi)有更新了，最近一段時(shí)間有點(diǎn)繁忙。今天，一起來(lái)學(xué)習(xí)一下一個(gè)和Circo圖差不多的圖：Edge Bunding圖（不知道中文咋翻譯）。其實(shí)在我...
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網(wǎng)絡(luò)-visNetwork包繪制炫酷的動(dòng)態(tài)網(wǎng)絡(luò)圖visNetwork是一個(gè)用于網(wǎng)絡(luò)可視化的R包，使用的是vis.js javascript庫(kù)(http://visjs.org[http://v...
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