環形RNA是一類在真核生物中廣泛存在的具有特殊環狀結構的非編碼RNA分子。已有文獻表明，在生物體內，環形RNA有著miRNA海綿、RBP海綿以及...
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【circRNA】circRNA的定量-CIRIquant篇 -
【circRNA】circRNA鑒定-find_circ篇Find_circ工具是最早利用高通量測序數據預測環狀RNA的開山鼻祖。該工具是Memczak等人2013年在權威Nature雜志上發表題為“C...
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【circRNA】circRNA鑒定-CIRCexplorer2篇今天測試另一個環狀RNA預測的重要軟件——CIRCexplorer2。該軟件是由中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究...
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【circRNA】circRNA鑒定-CIRI2篇circRNA的生信分析根據鑒定的方法不同可以分為以下兩種： split-alignment-based approaches：針對內含子驅動模...
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【circRNA】circRNA的鑒定通過spliced reads的mapping能發現線性RNA和環狀RNA的剪切方式不同。一個是正常的5’/3’前后剪切，一個是反向的5’/3’...
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【circRNA】circRNA的后期驗證隨著去除核糖體測序技術深入發展，越來越多的環狀RNA（circRNA）不斷報道發現，基于生物信息學分析顯示circRNA發揮著極其重要的生物學功...
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【circRNA】circRNA簡介（1）cirRNA是非編碼RNA中的一大類，它由一種非經典剪接方式——反向剪接(backsplicing)產生；當反向剪接發生時，下游剪接位點與上游剪...
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