用scikit-learn做數據降維

主成分分析 PCA: principal component analysis

主成分分析是一種簡化數據集維數的技術。特點是保存數據集中對方差影響最大的那些特征。

在信息理論中,信號會有較大的方差,噪聲會有較小的方差。用我們自己的想法,在多維數據中選出最有代表性的一維一定是差別較大的一維。

具體的計算方法可以參考這篇文章:主成分分析(Principal components analysis)-最大方差解釋

在 scikit-learn 這個工具下,進行主成分分析用的是 PCA 類。Python代碼是:

from sklearn.decomposition import PCA

PCA有許多種方式,參考:sckikit-learn 上的 PCA 頁

隨機映射 random projection

sklearn.random_projection 模塊實現了一種簡單和計算高效的方法,通過交易控制量的精度(作為附加方差),以縮短數據的維數,從而縮短處理時間和縮小模型大小。 該模塊實現兩種類型的非結構化隨機矩陣:高斯隨機矩陣和稀疏隨機矩陣。

隨機映射矩陣的維度和分布是被控制的,為了保證在數據集中任意兩個樣本的距離。隨機映射也是一種合適的基于距離的近似精確的方法。

Johnson-Lindenstrauss Lemma 定理保證了降維方法精度的上下限。johnson_lindenstrauss_min_dim 是找到一個數量能保證隨機降維到這個數量的矩陣。n_samples 是樣本的數量,eps 是由 J-L 定理定義的最大失真率。

>>> from sklearn.random_projection import johnson_lindenstrauss_min_dim
>>> johnson_lindenstrauss_min_dim(n_samples=1e6, eps=0.5)
663
>>> johnson_lindenstrauss_min_dim(n_samples=1e6, eps=[0.5, 0.1, 0.01])
array([    663,   11841, 1112658])
>>> johnson_lindenstrauss_min_dim(n_samples=[1e4, 1e5, 1e6], eps=0.1)
array([ 7894,  9868, 11841])
前后任意兩點$a,b$之間的距離有不等式保證
高斯隨機映射 Gaussian random projection

sklearn.random_projection.GaussianRandomProjection 通過將原始輸入空間投影在隨機生成的矩陣上來降低維度。代碼如下:

>>> import numpy as np
>>> from sklearn import random_projection
>>> X = np.random.rand(100, 10000)
>>> transformer = random_projection.GaussianRandomProjection()
>>> X_new = transformer.fit_transform(X)
>>> X_new.shape
(100, 3947)
稀疏隨機映射 Sparse random projection

相比于高斯隨機映射,稀疏隨機映射會更能保證降維的質量,并帶來內存的使用效率和運算效率。

使用方法如下:

>>> import numpy as np
>>> from sklearn import random_projection
>>> X = np.random.rand(100,10000)
>>> transformer = random_projection.SparseRandomProjection()
>>> X_new = transformer.fit_transform(X)
>>> X_new.shape
(100, 3947)
特征聚集 Feature agglomeration

把那些效果或行為相似的特征起來,達到降維的目的。
利用的是下面的類:

sklearn.cluster.FeatureAgglomeration

由于例子過于復雜,把本方法的使用說明使用說明貼上。

最后編輯于
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯系作者
平臺聲明:文章內容(如有圖片或視頻亦包括在內)由作者上傳并發布,文章內容僅代表作者本人觀點,簡書系信息發布平臺,僅提供信息存儲服務。
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 229,406評論 6 538
  • 序言:濱河連續發生了三起死亡事件,死亡現場離奇詭異,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機,發現死者居然都...
    沈念sama閱讀 99,034評論 3 423
  • 文/潘曉璐 我一進店門,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人,你說我怎么就攤上這事。” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 177,413評論 0 382
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長。 經常有香客問我,道長,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 63,449評論 1 316
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮,結果婚禮上,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 72,165評論 6 410
  • 文/花漫 我一把揭開白布。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發上,一...
    開封第一講書人閱讀 55,559評論 1 325
  • 那天,我揣著相機與錄音,去河邊找鬼。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛,可吹牛的內容都是我干的。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 43,606評論 3 444
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側響起,我...
    開封第一講書人閱讀 42,781評論 0 289
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后,有當地人在樹林里發現了一具尸體,經...
    沈念sama閱讀 49,327評論 1 335
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 41,084評論 3 356
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時候發現自己被綠了。 大學時的朋友給我發了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 43,278評論 1 371
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖,靈堂內的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 38,849評論 5 362
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站,受9級特大地震影響,放射性物質發生泄漏。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環境...
    茶點故事閱讀 44,495評論 3 348
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧,春花似錦、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 34,927評論 0 28
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽。三九已至,卻和暖如春,著一層夾襖步出監牢的瞬間,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 36,172評論 1 291
  • 我被黑心中介騙來泰國打工, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 52,010評論 3 396
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 48,241評論 2 375

推薦閱讀更多精彩內容